Affar, El Bachir, Ph.D.

Coordonnées

Centre de recherche
Hôpital Maisonneuve-Rosemont
T 514 252-3400 #3343
F 514 252-3430

el.bachir.affar@umontreal.ca


Axes de recherche

  • Interactions protéiques
  • Signalisation intracellulaire
  • Cancérologie
  • Protéomique

Description de la recherche

  • Signalisation via l’ubiquitination
  • Processus associés à L’ADN (transcription et réparation de l’ADN)
  • Bases moléculaires du cancer

L’ubiquitination est une modification post-traductionnelle qui joue un rôle primordial dans la régulation de plusieurs fonctions cellulaires. D’un point de vue clinique, des mutations de nombreux gènes du système ubiquitine ont été liées de manière causale à diverses maladies, dont le cancer. L’ubiquitination est un processus réversible dû à la présence des déubiquitinases (enzymes qui enlèvent spécifiquement l’ubiquitine des protéines cibles). Bien que les déubiquitinases soient peu connues, elles sont néanmoins en train d’émerger comme des régulateurs centraux du système ubiquitine.

Notre objectif est de caractériser les fonctions biologiques et les mécanismes d’action des déubiquitinases impliquées dans la transcription et la réparation de l’ADN, deux processus dont la dérégulation joue un rôle fondamental dans le développement du cancer.

Nous utilisons des approches de biochimie, de biologie moléculaire et de culture cellulaire, à la fine pointe de la technologie, afin de caractériser les fonctions des déubiquitinases.

Nos travaux permettent une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le système ubiquitine. De plus, de nouveaux concepts pourront être développés concernant la régulation de la transcription et la réparation de l’ADN. D’autre part, nos travaux devraient contribuer à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques pour traiter le cancer en médecine personnalisée.

Research axis

  • Protein interactions
  • Intracellular signaling
  • Cancer
  • Proteomic

Research description

  • Ubiquitin signaling
  • DNA-dependent processes (transcription and DNA repair)
  • Molecular basis of cancer

Ubiquitination is a post-translational modification that plays a key role in regulating a number of cellular functions. Clinically speaking, the mutations of many genes in the ubiquitin system have been causally linked to various diseases, including cancer.  Ubiquitination is a reversible process due to the presence of deubiquitinating enzymes, or enzymes that specifically remove ubiquitin from target proteins. Although deubiquitinating enzymes are not well understood, they are nevertheless emerging as central regulators in the ubiquitin system.

Our goal is to characterize the biological functions and mechanisms of action of the deubiquitinating enzymes involved in DNA transcription and repair, two processes whose deregulation plays a key role in the development of cancer.

We use state-of-the-art biochemistry, molecular biology, and cell culture approaches to characterize the functions of deubiquitinating enzymes. Our work provides a better understanding of the molecular mechanisms governing the ubiquitin system. New concepts may also be developed with regard to the regulation of DNA transcription and repair.

Our work should also help identify new therapeutic targets to treat cancer with personalized medicine.

Publications

  • Polycomb group-mediated histone H2A monoubiquitination in epigenome regulation and nuclear processes. Barbour H, Daou S, Hendzel M, Affar EB. Nat Commun. 2020 Nov 23;11(1):5947. doi: 10.1038/s41467-020-19722-9.
  • Roles and mechanisms of BAP1 deubiquitinase in tumor suppression. Masclef L, Ahmed O, Estavoyer B, Larrivée B, Labrecque N, Nijnik A, Affar EB. Cell Death Differ. 2021 Feb;28(2):606-625. doi: 10.1038/s41418-020-00709-4. Epub 2021 Jan 18.
  • Monoubiquitination of ASXLs controls the deubiquitinase activity of the tumor suppressor BAP1.Daou S, Barbour H, Ahmed O, Masclef L, Baril C, Sen Nkwe N, Tchelougou D, Uriarte M, Bonneil E, Ceccarelli D, Mashtalir N, Tanji M, Masson JY, Thibault P, Sicheri F, Yang H, Carbone M, Therrien M, Affar EB. Nat Commun. 2018 Oct 22;9(1):4385. doi: 10.1038/s41467-018-06854-2.
  • USP42 deubiquitinase in the arena of liquid-liquid phase separation and nuclear speckles. Uriarte M, Milot E, Affar EB. Cell Death Differ. 2021 Jun;28(6):2022-2024. doi: 10.1038/s41418-021-00794-z. Epub 2021 May 10.
  • A potent nuclear export mechanism imposes USP16 cytoplasmic localization during interphase. Sen Nkwe N, Daou S, Uriarte M, Gagnon J, Iannantuono NV, Barbour H, Yu H, Masclef L, Fernández E, Zamorano Cuervo N, Mashtalir N, Binan L, Sergeev M, Bélanger F, Drobetsky E, Milot E, Wurtele H, Costantino S, Affar EB. J Cell Sci. 2020 Feb 24;133(4):jcs239236. doi: 10.1242/jcs.239236.